L’inventaire présenté ci-dessous n’est pas exhaustif et ne contient que les lignes d’intérêt général. Il est complété au fur et à mesure de la recherche et de l’étude des lignes oubliées. Les lignes répertoriées sont celles qui sont partiellement ou totalement fermées aux voyageurs, inexploitées, déposées ou déclassées. Pour effectuer une recherche, rendez-vous sur la page Rechercher une ligne oubliée.
| Ligne | Num. | Long. | Région(s) |
|---|---|---|---|
| Poinson-Beneuvre – Langres | 842 000 | 46,5 | Grand Est |
| Culmont-Chalindrey – Gray | 846 000 | 44,9 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Vaivre – Gray | 847 000 | 53,1 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Gray – Saint-Jean-de-Losne | 851 000 | 54,6 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Gray – Fraisans | 853 000 | 43,0 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Belfort – Delle | 854 000 | 21,5 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Montagney – Miserey | 855 000 | 28,0 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Besançon-Viotte – Vesoul | 856 000 | 63,8 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Montbozon – Lure | 857 000 | 39,8 | Bourgogne-Franche-Comté |
| Montbéliard – Morvillars | 858 000 | 18,3 | Bourgogne-Franche-Comté |